Instituutin koulutustoiminnan keskeinen osa ovat Lähi-idässä järjestettävät kurssit ja ekskursiot opiskelijoille sekä arabian kielen ja seemiläisten kielten opetus. Koulutusten aiheet liittyvät monipuolisesti Lähi-idän tutkimuksen eri osa-alueisiin, maihin ja aikakausiin. Korkeatasoiset ja osallistujille edulliset kurssit on suunnattu yliopisto-opiskelijoille, joita osallistuu kursseille monista Suomen yliopistoista.
Lisäksi instituutti järjestää täydennyskoulusta suomalaisille opettajille. Kursseja on järjestetty yhteistyössä Suomen uskonnonopettajien liiton (SUOL) ja Historian ja yhteiskuntaopin opettajien liiton (HYOL) kanssa.
Instituutti tarjoaa myös kaikille avoimia Lähi-itään liittyviä verkkokursseja. Verkkokurssit ovat maksuttomia eivätkä vaadi ennakko-osaamista. Kursseja voi suorittaa täydennyskoulutuksena tai silkasta uteliaisuudesta. Kurssit voi suorittaa itsenäisesti omassa tahdissa tietokoneella tai muulla älylaitteella.
